ID | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gm9943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | predicted gene 9943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AC164957.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Not available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | A9681 (G3) of strain atchoum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 16151701-16152339 bp(+) (NCBIm37) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 16235254 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 85% (88/103) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Nature of Mutation |
DNA sequencing using the SOLiD technique identified a T to A transversion at position 256 of the Gm9943 transcript (please see Ensembl). The mutated nucleotide creates a premature stop codon at amino acid 38 (normally a leucine) deleting 48 amino acids from the C-terminus of the encoded protein. The mutation has been confirmed by DNA sequencing using the Sanger method (Figure 1).
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Protein Function and Prediction |
Gm9943 is an uncharacterized gene that is predicted to encode an 85 amino acid protein. Analysis using the SMART program predicts that the polypeptide sequence contains a signal peptide at amino acids 1-21.
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Note | also present in stock# ZE80 |
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Posted On | 2009-11-10 |