ID | 156859 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zdhhc16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger, DHHC domain containing 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500015N03Rik, Ablphilin 2, Abl-philin 2, APH2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039400-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? |
Possibly essential
(E-score: 0.613)
![]() |
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Stock # | R1335 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 41921919-41932543 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 41929073 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000153627 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000026154] [ENSMUST00000026168] [ENSMUST00000163287] [ENSMUST00000163398] [ENSMUST00000164776] [ENSMUST00000167927] [ENSMUST00000224562] [ENSMUST00000223802] [ENSMUST00000225968] [ENSMUST00000224258] [ENSMUST00000224896] [ENSMUST00000171561] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9ESG8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000026154 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000026154 Gene: ENSMUSG00000025157
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000026168 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000026168 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000163287 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128653 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000163398 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164776 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000166090 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131219 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167927 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132483 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000169779 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170209 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000224562 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223785 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000223802 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223768 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000225968 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224258 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224537 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224896 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223624 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000225433 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000171561 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130900 Gene: ENSMUSG00000025159
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Meta Mutation Damage Score | 0.9755 ![]() |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (32/32) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a null mutation display prenatal and neonatal lethality with bradycardia, abnormal heart morphology and eye defects. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zdhhc16 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTCTTGTGGGTGTAGCCACATAGTG -3' (R):5'- AGCATTCTTTGCCAGCCTCAGAC -3' Sequencing Primer (F):5'- GCAAGCTACAGATTCAGTTAGTTCC -3' (R):5'- gcatacgcccttactccc -3' |
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Posted On | 2014-02-11 |