ID | 151530 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zdhhc16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger, DHHC domain containing 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500015N03Rik, Ablphilin 2, Abl-philin 2, APH2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039325-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.613) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1258 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 41921919-41932543 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 41926483 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Methionine at position 89 (V89M) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000153627 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000026154] [ENSMUST00000075280] [ENSMUST00000112123] [ENSMUST00000167927] [ENSMUST00000171561] [ENSMUST00000224258] [ENSMUST00000224562] [ENSMUST00000225968] [ENSMUST00000224896] [ENSMUST00000223802] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9ESG8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000026154 AA Change: V89M PolyPhen 2 Score 0.078 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.85) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000026154 Gene: ENSMUSG00000025157 AA Change: V89M
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000075280 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000074756 Gene: ENSMUSG00000034321
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000112123 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000107751 Gene: ENSMUSG00000034321
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167927 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132483 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000171561 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130900 Gene: ENSMUSG00000025159
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223624 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223768 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224258 AA Change: V89M PolyPhen 2 Score 0.385 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000224562 AA Change: V89M PolyPhen 2 Score 0.642 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000225968 AA Change: V69M PolyPhen 2 Score 0.162 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000223785 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000225433 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224896 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000223802 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000224537 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a null mutation display prenatal and neonatal lethality with bradycardia, abnormal heart morphology and eye defects. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zdhhc16 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGATGCTGCCTTTGAGCCTGTC -3' (R):5'- AGCAATGTCATTCCTGCCCTGTG -3' Sequencing Primer (F):5'- TGGACAATGTGATCCGCTG -3' (R):5'- GAGAAGATTTCTGCCTCCAAAG -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |